试论周期细胞周期蛋白生物信息学

论文导读：
摘要：细胞周期蛋白是细胞分裂中重要的调控因子之一,在细胞周期中,周期蛋白结合并激活CDK活性,发挥对细胞周期的调控作用。前人探讨表明周期蛋白在分子结构上有一段保守的250个左右氨基酸残基的cycpn core结构域, cycpn core包含2个结构域：cycpn_N(N端cycpn box)和cycpn_C(C端cycpn box)。本实验以GeneBank为数据库,选取了其中10个方式物种的365条周期蛋白序列作为基础数据,并按它们的结构域特点进行分类。重点浅析了完整双域和完整单一cycpn box域这两种情况,然后对构建出的系统发育树中一些特殊周期蛋白进行了浅析,以而总结出如下一些主要结论：1、越是高等的生物含有周期蛋白的不论种类和数量都要越多,这也表明了高等生物有着更复杂的细胞周期调控机制。动物的周期蛋白种类要普遍多于植物、真核单细胞生物和原核生物中的,但植物中含有的大多数亚型成员要多于动物中的。2、 cycpn_C(?)吉构域在某些周期蛋白中是一个重要的结构,它对这些周期蛋白在细胞周期所发挥的功能有着很大的联系。3、在真核单细胞周期蛋白序列中,G2/M期的周期蛋白都含有双结构域,而G1/S期的周期蛋白绝大多数都出现在单域中,不含有cycpn_C结构域。4、不同物种间命名不同的周期蛋白可能会在它们各自的细胞周期中发挥相似的作用,如植物cycpn U/P和动物cycpn Y的联系；同种物种内一些周期蛋白可能会取代此物种所缺乏的周期蛋白的作用,如植物中所缺乏的cycpn E可能会被其他周期蛋白填补其功能。5、真核型细胞周期蛋白的进化走势是增加类型和数量,动物以增加细胞周期蛋白的类型为主,而植物则是以增加细胞周期蛋白类型中的成员为主;另一进化走势是由单域向双域进展,物种进化程度越高,所具有的双域细胞周期蛋白的类型就越多。关键词：细胞周期蛋白论文细胞周期论文结构域论文进化浅析论文
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Abstract7-10
第1章 文献综述10-21
引言10-11

1.1 细胞周期11-14

1.1 细胞周期的概述11

1.2 细胞周期中的主要调控及调控因子11-14

1.2 细胞周期蛋白氨基酸序列结构特点14-15

1.2.1 cycpn core和cycpn box14-15

1.2.2 细胞周期蛋白其他结构域15

1.3 细胞周期蛋白的进化浅析探讨进展15-19

1.3.1 主要方式植物周期蛋白进化浅析15-19

1.3.2 动植物的周期蛋白的进化比较19

1.4 一些特殊的细胞周期蛋白19-21

第2章 十个物种细胞周期蛋白家族序列浅析21-41

2.1 实验资源和策略21-23

2.

1.1 NCBI数据库21

2.

1.2 浅析软件21

2.

1.3 实验策略21-23

2.

1.3.1 周期蛋白序列基础数据的收集22

2.

1.3.2 物种的选取22-23

2.

1.3.3 结构域的分类23

2.

1.3.4 单、双结构域序列的核对整理23

2.

1.3.5 系统发育树的构建23

2.2 结果与浅析23-38

2.1 基础数据24-27

2.2 各类周期蛋白在10个物种中的有着情况27-28

2.3 周期蛋白序列结构域分类结果28-31

2.4 各类周期蛋白在单、双域中有着情况31-32

2.5 完整单、双域中序列浅析32-36

2.6 完整双域和完整单域比较浅析36-38

小结38

2.3 讨论38-41

致谢41-42
参考文献42-46
攻读硕士阶段的科研成果46-47
缩略语表47