谈谈退化神经退化疾病相关氨基酸变异数据库构建及生物信息学

论文导读：
摘要：神经退化疾病（NDD），又叫神经退行性疾病，是由于神经的功能障碍所造成的一类常见疾病。探讨表明神经退化疾病通常都涉及遗传变异，包括点变异，插入和缺失。已报道的神经退化疾病的发病机理和涉及到的变异都有几点共同的特点，由此需要建立一个基于文献的整合型神经退化疾病相关氨基酸变异数据库体系，以而更好地帮助探讨者全面、整体地探讨疾病与遗传变异之间的联系。尽管目前已经有几点单个神经退化疾病相关氨基酸变异的数据库被发表，但是并没有一个整合全部40余种神经退化疾病相关氨基酸变异的数据库。本课题的目标是全面收集神经退化疾病相关氨基酸的变异数据，设计和构建成一个基于LAMP技术，并整合一系列web工具的在线神经退化疾病相关氨基酸变异数据库体系“NDDMD”（www.ibio-cn.org/NDDMutbase）。该数据库收入全部神经退化疾病的相关基因从及氨基酸变异信息，全部氨基酸变异数据都是以PubMed文献中人工提取并保持更新。目前数据库中有140个相关的基因信息从及4000余条变异信息。数据库还提供友好的用户界面方便查看检索和导出，同时整合目前流行的LOVD界面，数据库目前已上线并可正常访问。此外，本课题还对数据库中已有的数据进行一系列统计分析，同时也对神经退化疾病相关氨基酸的变异对蛋白质聚集和稳定性的影响进行分析，获得神经退化疾病与变异在体系层次上相对通用的一系列结论。关键词：神经退化疾病论文变异数据库论文LOVD论文聚集和稳定性论文
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Abstract5-8
第一章 绪论8-14

1.1 神经退化疾病极为探讨发展8-10

1.1 神经退化疾病介绍极为探讨近况8-9

1.2 神经退化疾病相关变异数据库9-10

1.2 生物学基础和生物信息学软件10-12

1.2.1 生物学基础10-11

1.2.2 生物信息学软件11-12

1.3 课题探讨的目的和作用12-13

1.4 本论文的主要内容和章节13-14

第二章 神经退化疾病氨基酸变异数据库14-30

2.1 引言14

2.2 开发工具简介14-16

2.1 操作体系14

2.2 Web 开发技术14-15

2.3 Web 开发方式15

2.4 数据库案例15

2.5 硬件环境15-16

2.3 体系需求分析和设计16-21

2.3.1 体系任务16-17

2.3.2 功能需求描述17

2.3.3 需求建模17-19

2.3.4 数据字典19-21

2.4 数据结构21-24

2.4.1 E-R 图建模21

2.4.2 数据库表结构21-24

2.5 详细设计和用户界面24-28

2.5.1 体系功能模块图24-25

2.5.2 用户界面25-28

2.6 LOVD 界面整合28-30

2.6.1 LOVD 介绍28

2.6.2 LOVD 界面整合28-30

第三章 数据收集和统计分析30-36

3.1 数据源和收集30

3.2 变异统计和分析30-36

第四章 神经退化疾病氨基酸变异的生物信息学分析36-42

4.1 引言36-37

4.2 神经退化疾病相关氨基酸变异对蛋白质聚集影响的预测37-40

4.

2.1 思路和办法37-38

4.

2.2 结果和分析38-40

4.3 神经退化疾病相关氨基酸变异对蛋白质稳定性的影响预测40-42
4.

3.1 思路和办法40-41

4.

3.2 结果和分析41-42

第五章 总结和展望42-44

5.1 结论42

5.2 展望42-44

参考文献44-48
致谢48-49