简谈色氨酸精氨酸、色氨酸与ctDNA作用机理

论文导读：
摘要：DNA是基本的遗传物质,是许多药物的主要意义靶点,其结构在很多条件下可从被破坏,尤其是和小分子相互意义,所从DNA可从用于许多类型疾病的诊断和治疗。氨基酸类药物因其特殊生理功能而成为运用最为广泛的生化药物,近年来我国氨基酸类药物进展迅速,氨基酸及氨基酸衍生物可能成为药物进展的新方向。蛋白质多肽类药物是一类具有天然结构和高度生理活性的新型药物,其中大部分的多肽可从作药物前体。与小分子化学药物相比,多肽、蛋白质药物所具有的高针对性和高活性特点使其成为治疗人类疾病的不可缺少之物。目前,有关氨基酸、蛋白质肽类药物的探讨已成为生物化学和生命科学中热门探讨课题之一,但运用光谱法探讨其作为靶向药物与DNA相互意义的报道并不多见。对于氨基酸、蛋白质肽类药物和DNA相互意义的探讨有助于人们进一步理解药物小分子与DNA的相互意义方式和构效联系,对于以分子水平上理解诸多氨基酸、蛋白质肽类药物的意义机理从及设计新型特效的DNA靶向药物具有重要的论述和实际运用价值。第一部分：从中性红NR为荧光探针,通过紫外-可见吸收光谱、荧光光谱、圆二色谱等光谱学技术探讨Arg与小牛胸腺DNA的相互意义。紫外吸收光谱从及荧光增敏现象表明在pH=4时,Arg结构中的胍基通过静电意义与ctDNA发生相互意义,Arg通过转变DNA的空间结构增强DNA-NR系统的荧光强度。各种实验结果相互补充、相互印证,发现Arg结构中的胍基通过静电结合方式与ctDNA骨架上的磷酸根发生意义。在光谱学探讨的基础上,使用AutoDock软件进行分子模拟,实验结果进一步证明了这一结论。第二部分：用荧光光谱法及紫外光谱法探讨了L-Trp与ctDNA分子之间的相互意义历程,实验发现DNA能降低L-Trp的荧光,在不同温度下考察了DNA对L-Trp荧光猝灭的状况,得出DNA对L-Trp的荧光猝灭属静态猝灭历程；通过探讨DNA与L-Trp相互意义的紫外光谱发现,DNA没有使L-Trp的吸收峰发生减色红移现象,推断L-Trp与DNA不有着嵌插意义；通过考察了离子强度的影响,排除L-Trp与DNA之间有着静电意义。同时通过I-离子效应发现,I-对DNA-L-Trp复合物荧光的猝灭效应大于对L-Trp荧光的猝灭效应,这符合沟槽结合方式的特点。探讨证实,在生理条件下,L-Trp与DNA之间有着显著的相互意义,结合模式主要是沟槽方式。第三部分：采取荧光光谱法和吸收光谱法为主要手段,结合分子模拟实验,在接近人体生理条件的Tris-HCI缓冲溶液中探讨了WR二肽与ct-DNA的相互意义,研究了二者意义模式和意义机理。化合物与目标靶分子结合后,荧光发射强度、紫外吸光度和圆二色谱产生了变化。荧光和紫外吸收光谱表明WR与ctDNA之间符合沟槽方式,结合常数为4.1×103。离子效应和DNA变性实验进一步验证了WR与ctDNA相互意义的方式为混合方式。分子模拟探讨结果说明,结合历程的主要意义力为范德华和氢键意义。探讨结果为研究小肽与核酸相互意义机理提供了可参考的论述和实验依据,为设计新型药物提供了指导性信息。第四部分：使用多种光谱学技术与分子模拟办法探讨了WAR与ctDNA的相互意义。发现ctDNA对WAR具有荧光猝灭意义,计算了不同温度下的结合常数和猝灭常数,得出其猝灭模式主要是静态猝灭。荧光光谱和紫外光谱初步判断其结合模式为沟槽结合,DNA变性实验进一步证明WAR与ctDNA主要是通过沟槽模式结合,离子强度实验则证明三肽与DNA之间还有着静电意义。通过分子模拟办法可从得出WAR结合于DNA的大沟区中,其主要意义力为氢键与范德华力,这与光谱学实验的结果是相一致的。关键词：小牛胸腺DNA(ctDNA)论文精氨酸(Arg)论文色氨酸(唧)论文精氨酰-色氨酸(WR)论文精氨酰-丙氨酰-色氨酸(WAR)论文光谱论文
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ABSTRACT9-12
符号说明12-13
第一章 绪论13-23

1.1 DNA与小分子的相互意义13-16

1.1 DNA的结构特点13-14

1.1.2 小分子与DNA的相互意义方式14-16论文导读：.2免疫学办法18-191.3.3同位素标记示踪法191.3.4其他办法191.4小分子与DNA相互意义的常用办法的探讨发展19-211.4.1紫外可见吸收光谱法191.4.2荧光光谱19-201.4.3圆二色谱法201.4.4拉曼光谱法201.4.5分子模拟技术20-211.4.6其他办法211.5本文的探讨作用及主要内容21-221.6本文的主要创新点22-23第二章精氨酸与c

1.2 氨基酸类药物16-17

1.2.1 我国氨基酸类药物的进展16

1.2.2 氨基酸的药用概况16-17

1.3 肽与蛋白质药物探讨近况17-19

1.3.1 生物检定法18

1.3.2 免疫学办法18-19

1.3.3 同位素标记示踪法19

1.3.4 其他办法19

1.4 小分子与DNA相互意义的常用办法的探讨发展19-21

1.4.1 紫外可见吸收光谱法19

1.4.2 荧光光谱19-20

1.4.3 圆二色谱法20

1.4.4 拉曼光谱法20

1.4.5 分子模拟技术20-21

1.4.6 其他办法21

1.5 本文的探讨作用及主要内容21-22

1.6 本文的主要创新点22-23

第二章 精氨酸与ctDNA相互意义机理的探讨23-31

2.1 引言23-24

2.2 实验部分24-26

2.1 实验试剂24

2.2 实验仪器24-25

2.3 实验办法25

2.4 分子模拟25-26

2.3 结果与讨论26-30

2.3.1 紫外-可见吸收光谱26-27

2.3.2 荧光光谱27-28

2.3.3 圆二色光谱28-29

2.3.4 分子模拟29-30

2.4 结论30-31

第三章 色氨酸与ctDNA相互意义的探讨31-41

3.1 引言31

3.2 实验部分31-33

3.

2.1 实验试剂31-32

3.

2.2 实验仪器32

3.

2.3 实验办法32-33

3.3 结果与讨论33-40

3.1 紫外-可见吸收光谱33-35

3.2 荧光光谱35-39

3.3 圆二色光谱39-40

3.4 分子模拟40

3.4. 结论40-41

第四章 精氨酰-色氨酸与ctDNA相互意义机理的探讨41-54

4.1 引言41-42

4.2 实验部分42-44

4.

2.1 实验试剂42

4.

2.2 实验仪器42

4.

2.3 实验办法42-44

4.3 结果与讨论44-52
4.

3.1 紫外-可见吸收光谱44-46

4.

3.2 荧光光谱46-50

4.

3.3 圆二色光谱50-52

4.

3.4 分子模拟52

4.4 结论52-54
第五章 精氨酰-丙氨酰-色氨酸与ctDNA意义的探讨54-65

5.1 引言54

5.2 实验部分54-56

5.

2.1 实验试剂54-55

5.

2.2 实验仪器55

5.

2.3 实验办法55-56

5.3 结果与讨论56-64
5.

3.1 紫外-可见吸收光谱56-58

5.

3.2 荧光光谱58-62

5.

3.3 圆二色光谱62-63

5.

3.4 分子模拟63-64

5.4 结论64-65
第六章 全文总结与工作展望65-67

6.1 主要结论65-66

6.

1.1 L-Arg与ctDNA相互意义机理的探讨65

6.

1.2 L-Trp与ctDNA相互意义机理的探讨65

6.1.3 Arg-Trp和Arg-Ala-Trp与ctDNA相互意义机理的探讨65-66

6.2 工作展望66-67

参考文献67-77
致谢77-78
硕士探讨生期间发表的学术论文78-79
攻读硕士学位期间所获奖励79
硕士探讨生期间参与完成的科研项目79-80
附件80