试述艾滋病毒DAPY类化合物抗HIV-1野生型与耐药型病毒2-DQSAR

论文导读：病药物分子，定量构效联系(quantitativestructure-activityrelationship,QSAR)探讨作为分子结构修饰与分子优化设计的有力工具，被运用以对抑制HIV-1野生型与耐药性病毒活性的探讨。本论文通过DAPY类化合物抑制野生型、单突变Y181C、L100I、Y188LHIV-1病毒毒株活性的2D-QSAR探讨，对DAPY类分子与受体作用机理进行了探讨，并提
摘要：逆转录酶（reverse transcriptase，RT）依靠其DNA聚合酶活性和核糖核酸酶氢活性，将原病毒RNA转录成双链DNA，在HIV-1病毒生命周期中起着重要的作用。非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）作为一类与核苷类逆转录酶抑制剂（NRTIs）结构、作用机理迥异的特异性抑制HIV-RT的化合物，因其结构多样、高效低毒以及可与其他药物协同作用等优点，对其探讨是发现新型抗艾滋病药物的有效途径和重要策略。DAPY类化合物（Diarylprimidines,二芳基嘧啶类）作为其中中一种，具有对单突变与双突变毒株有很强的抑制活性和较小的毒副作用。为探明其DAPY类分子作用机理，选择出高效、高选择性和较好耐药性的抗艾滋病药物分子，定量构效联系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)探讨作为分子结构修饰与分子优化设计的有力工具，被运用以对抑制HIV-1野生型与耐药性病毒活性的探讨。本论文通过DAPY类化合物抑制野生型、单突变Y181C、L100I、Y188L HIV-1病毒毒株活性的2D-QSAR探讨，对DAPY类分子与受体作用机理进行了探讨，并提出了新的可能作用方式与优化分子结构修饰的方向。其具体的工作体现在以下3个方面：1选择量化计算的论述层级对DAPY类分子进行结构优化对DAPY类分子进行3个论述层次的量化计算，即半经验RM1，以头算法HF，密度泛函DFT，得到四个不同精度层次的DAPY类分子优化构象模型，即RM1，HF3-21*，HF6-31*，B3LYP6-31*。分别以这四个分子优化构象中读取量化参数并建立了对抑制活性的QSAR模型，模型之间体现出的共性或非共性联系，通过比较与讨论，可以得到许多有关分子作用机理的信息。2选取参数并构建QSAR模型本论文侧重于分子机理讨论，摒弃了其物理化学作用不明确的拓扑参数。选择了客观、准确和形象并具有明确物理作用的量子化学参数，结合几何结构参数、物化参数、指示性参数以构建对抑制HIV-1病毒的QSAR模型。在构建模型中采取了多元线性回归策略，以参数的选取到模型的构建严格遵循数理统计学的规律，最终并通过对模型的验证和显著性浅析以考察模型的稳定性与可靠性。3所建QSAR模型解释分子作用机理并提出结构修饰意见通过比较包含了不同精度层级计算的参数QSAR模型，浅析在不同毒株类型中QSAR模型中重要参数的显著性与否，并结合已有的文献报道，提出了可能的作用方式。通过对重要参数M8N的比较，模拟了部分分子优化构象，其结果显示出潜在的高抑制活性，以待实验进一步验证。关键词：艾滋病毒论文二芳基嘧啶类似物论文定量构效联系论文作用位点论文
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Abstract7-9
索引9-10
第一章 引言10-24

1.1 NNRTIS 概述10-17

1.2 定量构效联系探讨概述17-20

1.3 抗艾滋病药物 QSAR 探讨概述20-21

1.4 论述计算化学策略介绍21-24

第二章 抑制野生型 HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型构建24-31

2.1 有关参数的介绍24-25

2.2 参数的计算与选取25-26

2.3 参数选取26-27

2.4 回归方程模型27

2.5 讨论27-29

2.6 总结29-31

第三章 DAPY 类化合物抑制单突变型 Y181C、L100I、Y188L HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型的构建31-41
3.1 DAPY 类化合物抑制单突变型 Y181C HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型的构建31-37
3.2 DAPY 类化合物抑制单突变型 L100I HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型的探讨37-40
3.3 DAPY 类化合物抑制单突变型 Y188L HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型的探讨40-41
第四章 基于更高论述层级下对 DAPY类化合物抑制野生型、单突变型 L100I、Y181C、Y188L HIV-1 病毒活性的 QSAR 探讨41-49

4.1 DAPYS 抑制野生型 HIV-1 病毒活性论文导读：上一页12

的 QSAR 模型43-45
4.2 DAPYS 抑制单突变型 L100I HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型45-46
4.3 DAPYS 抑制单突变型 Y181C HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型46-48
4.4 DAPYS 抑制单突变型 Y188L HIV-1 病毒活性的 QSAR 模型48-49
第五章 DAPY 类分子抑制 HIV-1 病毒的活性的分子优化设计以及其作用机理的设想49-53

5.1 优化 DAPYS 的依据49-50

5.2 作用机理中作用位点的设想50-51

5.3 基于 QSAR 模型优化计算新分子51-53

参考文献53-59
附表59-71
作者在攻读硕士期间发表的论文目录71-72
致谢72