研究脊椎猪7号染色体上影响脊椎数变异VRTN因果突变位点筛选与验证

论文导读：摘要5-6ABSTRACT6-7第一章文章综述7-221猪的驯化与脊椎数的变异7-92猪脊椎数表型变异的育种作用93数量性状基因座(QTL)定位9-133.1数量性状基因座介绍9-103.2QTL定位10-133.2.1QTL定位的前提10-134猪脊椎数变异遗传学基础的前期探讨13-155SSC1和SSC7脊椎数主效QTL的最新探讨进展15-16

5.1猪1号染

摘要：猪脊椎数是影响长和产肉量的重要经济性状,具有很高的遗传力。为了剖析猪脊椎数表型变异的遗传机理,探讨人员利用不同的资源群体分别在猪1、7号染色体上定位到了影响猪脊椎数变异的主效QTL。 NR6A1基因c.134GA突变位点被鉴定为解释1号染色体上QTL效应的因果突变位点(QTN)。通过一系列的遗传浅析,2011年Mikawa等认为VRTN基因是7号染色体上影响猪脊椎数变异的候选因果基因(QTG),并发现了9个候选因果突变位点。本实验室前期构建了大规模白色杜洛克×二花脸F2资源群体,测定了1029头F2屠宰个体的脊椎数表型,通过全基因组扫描共检测到了12个影响猪脊椎数的QTL,验证了7号染色体上的主效QTL。本探讨在此基础上对VRTN基因9个候选QTN位点进行了筛选和影响效应浅析。在前期工作的基础上,采取标记辅助分离浅析策略判定了白色杜洛克×二花脸F2资源群体以及二花脸×通城猪F2资源群体共计30个F0/F,个体的QTL基因型。利用这30个个体对9个候选QTN进行PCR扩增及测序判型,通过比较判型结果与QTL基因型结果的一致性,确定了其中4个突变位点为候选因果突变。进一步通过哺乳动物多物种的序列保守性浅析,发现只有NV123ins291bp和NV027(2)CA两个位点符合因果突变的条件,其中NV123位点为291bp的大片段插入突变(PRE1元件),为最有可能的因果突变。该突变可能调节了同源异型框(homeobox)的表达,而同源异型框决定了胚胎期脊椎的分化,以而最终影响了脊椎数的数目。本探讨针对该位点在大规模杜长大三元杂交猪群中开展了与脊椎数表型的关联性浅析,结果显示该位点对猪胸椎数的影响效应极显著,ins/ins比-/-基因型的胸椎多出了0.9根,为种猪脊椎数的选育改良提供了重要的基因位点和分子标记。关键词：猪论文脊椎数论文QTL论文基因型论文QTN论文
本论文由www.7ctime.com,需要论文可以联系人员哦。摘要5-6
ABSTRACT6-7
第一章 文章综述7-22
1 猪的驯化与脊椎数的变异7-9
2 猪脊椎数表型变异的育种作用9
3 数量性状基因座(QTL)定位9-13

3.1 数量性状基因座介绍9-10

3.2 QTL定位10-13

3.

2.1 QTL定位的前提10-13

4 猪脊椎数变异遗传学基础的前期探讨13-15
5 SSC1和SSC7脊椎数主效QTL的最新探讨进展15-16

5.1 猪1号染色体上QTL精细定位及因果突变位点的鉴别15

5.2 猪7号染色体上QTL精细定位、候选因果基因及突变位点的搜寻15-16

5.3 其他染色体上影响猪脊椎数变异的QTL16

6 本实验室在剖析猪7号染色体上影响脊椎数QTL的相关工作16-20

6.1 影响猪脊椎数变异的QTL初步定位16-17

6.2 QTL区域选择性清除效应检测17

6.3 白色杜洛克×二花脸F_2资源家系F_1公猪QTL基因型判定17-18

6.4 SSC7上QTL区域单倍型浅析18-20

7 猪脊椎数变异探讨尚未解决的科学不足20-21
8 本探讨的目的及作用21-22
8.1 本探讨的目的21
8.2 本探讨的作用21-22
第二章 探讨正文22-38
1 前言22-23
2 实验材料与策略23-26

2.1 实验动物23

2.2 表型测定23

2.3 DNA样品制备23

2.4 VRTN基因候选QTN的判型23-24

2.5 候选QTN的保守性浅析24-25

2.6 NV123 ins 291bp在大规模远缘群体中的基因型判定25

2.7 数据的统计与浅析25-26

2.7.1 QTL基因型统计策略25

2.7.2 远缘群体基因型与表型的相关性浅析25-26

3 结果26-34

3.1 大规模远缘群体表型分布26

3.2 白色杜洛克×二花脸资源家系F_0母猪QTL基因型的判定26-27

3.3 二花脸×通城家系4头猪的QTL基因型判定27-28

3.4 利用QTL基因型已知个体筛选VRTN可能的因果突变28-29

3.5 候选QTN保守性浅析结果29-33

3.6 VRTN基因NV123 ins 291bp在远缘群体中的判型33

3.7 NV123 ins 291bp论文导读：在远缘群体中对脊椎数的影响效应33-344讨论34-384.1资源家系的构建34-354.2脊椎数变异的QTN起源不足354.3QTN鉴别和验证的策略与难度35-364.4VRTN基因最有可能的QTN36-374.5探讨成果在育种实践中的作用374.6展望37-38小结38-39参考文献39-42致谢42-43上一页12
在远缘群体中对脊椎数的影响效应33-34
4 讨论34-38

4.1 资源家系的构建34-35

4.2 脊椎数变异的QTN起源不足35

4.3 QTN鉴别和验证的策略与难度35-36

4.4 VRTN基因最有可能的QTN36-37

4.5 探讨成果在育种实践中的作用37

4.6 展望37-38

小结38-39
参考文献39-42
致谢42-43