试谈扩增先天性心脏病患儿CITED2基因突变及22q11微缺失

论文导读：然后用连接酶连接半探针,最后用统一的SALSAPCR引物对连接的半探针进行PCR扩增。利用毛细管电泳仪(CEQ8800)和与之配套的软件(CEQsystem)来分离和浅析PCR产物。将CEQsystem浅析后的数据转换为Excel格式,最后利用MRC-Holland公司提供的浅析软件Coffalyserv9.4来浅析数据。10例正常儿童作为浅析对照。结果

1.300例CHD患儿中,

摘要：背景先天性心脏病(congenital heart disease, CHD)是胎儿时期心脏血管发育异常所致的心血管畸形,也是小儿最常见的心脏病。其临床后果及其严重,通常导致流产、死胎、死产、新生儿死亡,以及儿童、青少年和成人残疾。CHD发生率在城市地区一直高居首位,在农村地区仅次于神经管畸形,位于第二位,给家庭和社会造成严重的经济和精神等方面的负担。虽然目前CHD遗传基础的探讨已取得了很多进展,但是由于CHD种类繁多、病因复杂,大多数CHD的病因尚未清楚,急需人们多层次、多水平、深入全面综合地探讨。目的浅析CHD患儿的CITED2基因编码链突变的情况；检测CHD患儿22q11微缺失的发病及分布情况,探讨多重连接依赖式探针扩增技术(multiplex pgation-dependent probe amppfication, MLPA)用于诊断CHD22q11微缺失的可行性。策略以2010～2011年河南省胸科医院及郑州市儿童医院收集的300例散发型CHD患儿为探讨对象。300例患儿均为汉族,且均经临床、心脏彩超、手术确诊。50例正常男童及50例正常女童作为本探讨的正常对照,均无CHD病史及家族史。利用非试剂盒策略提取外周血基因组DNA,对CITED2基因进行聚合酶链反应并测序,测序结果与GeneBank数据库公布的CITED2基因序列(NM006079.3)进行比较以识别基因突变。用Clustal X软件浅析突变氨基酸的保守性。采取MLPA P250试剂盒(共48对探针)对120例CHD患儿进行22q11微缺失检测。所有反应在PCR仪上进行：DNA样品与48对探针杂交16h,然后用连接酶连接半探针,最后用统一的SALSA PCR引物对连接的半探针进行PCR扩增。利用毛细管电泳仪(CEQ8800)和与之配套的软件(CEQ system)来分离和浅析PCR产物。将CEQ system浅析后的数据转换为Excel格式,最后利用MRC-Holland公司提供的浅析软件Coffalyser v9.4来浅析数据。10例正常儿童作为浅析对照。结果1.300例CHD患儿中,有5例(1.67%)检测出CITED2基因突变。其余295例(98.33%)没有检测出突变。新发现了两种新的突变(c.481-483delAGC, c.574-579delAGCGGC)。2.120例CHD患儿中,检出22q11微缺失10例(8.33%),重复1例(0.83%),其余109例(90.84%)没有检测到缺失或重复。10例缺失中,3Mb缺失9例,2Mb缺失1例,包括室间隔缺损3例,法洛四联症5例,肺动脉狭窄1例,右室双出口1例。1例重复CHD类型为肺动脉狭窄。结论1.在CHD患儿CITED2基因中发现两种突变,两种突变均为国际首次报道。多物种序列比较浅析表明CITED2第161、192和193位氨基酸呈现一定的保守性,提示这两种新突变可能通过转变SGJ区蛋白构象导致人类CHD的发生。2.CHD患儿中有着一定比例的22q11微缺失。MLPA是一种快速、简便且准确的检测22q11微缺失的策略关键词：先天性心脏病论文CITED2论文突变论文微缺失论文多重连接依赖式探针扩增技术论文
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Abstract8-11
第一部分 先天性心脏病患儿CITED2基因突变检测11-26
前言11
1 材料和策略11-17

1.1 探讨对象11-12

1.2 实验仪器及试剂12-13

1.2.1 主要仪器12-13

1.2.2 主要试剂13

1.3 探讨策略13-17

1.3.1 基因组DNA的提取与检测13-14

1.3.2 PCR引物合成14-15

1.3.3 CITED2基因PCR扩增及测序15-17

1.3.4 测序浅析17

2 结果17-20
3 讨论20-22
4 结论22-23
参考文献23-26
第二部分 先天性心脏病患儿22qll微缺失的探讨26-41
前言26-27
1 材料和策略27-31

1.1 探讨对象27

1.2 材料27-28

1.2.1 主要仪器27-28

1.2.2 主要试剂28论文导读：1.3探讨策略28-311.3.1基因组DNA提取与检测281.3.2MLPA28-311.3.3毛细管电泳检测与数据处理312结果31-353讨论35-374结论37-38参考文献38-41综述41-57参考文献50-57附录57-60攻读学位期间发表文章情况60-61致谢61-62个人简历62上一页12

1.3 探讨策略28-31

1.3.1 基因组DNA提取与检测28

1.3.2 MLPA28-31

1.3.3 毛细管电泳检测与数据处理31

2 结果31-35
3 讨论35-37
4 结论37-38
参考文献38-41
综述41-57
参考文献50-57
附录57-60
攻读学位期间发表文章情况60-61
致谢61-62
个人简历62