试谈食管癌遗传变异与食管癌及T细胞淋巴瘤关联
最后更新时间：2024-01-22
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论文导读：对10-7P≤104的SNP进行扩大样本量(10,123例食管癌和10,664例正常对照)验证,并进行全基因组基因-饮酒交互作用浅析。我们发现9个新的食管癌易感位点,其中位于4q23、16q12.1、17q21、22q12、3q27、17p13和18p11的7个SNP显示显著性边际效应(P=1.78×10-39-2.79×10-9)；而另外位于2q22和13q33的2个SNP只以基因-饮酒交互作用方式与食
摘要：越来越多的探讨证据表明遗传变异在疾病的易感性和发生进展中起重要作用。本探讨以我国常见的食管鳞状细胞癌(简称食管癌)和少见的非霍奇金T细胞淋巴瘤(简称T细胞淋巴瘤)为模型,浅析单核苷酸多态(SNP)对食管癌易感性和对T细胞淋巴瘤预后的影响。对食管癌我们运用全基因组关联探讨(GWAS)对策,对T细胞淋巴瘤我们采取候选基因浅析对策。食管癌全基因组关联探讨包括全基因组筛查、一期验证和二期验证。全基因组筛查和最关联的一些易感位点(P10-7)数据已经报道(Wu et al.,2011)。本探讨在此基础上对10-7P≤104的SNP进行扩大样本量(10,123例食管癌和10,664例正常对照)验证,并进行全基因组基因-饮酒交互作用浅析。我们发现9个新的食管癌易感位点,其中位于4q23、16q12.1、17q21、22q12、3q27、17p13和18p11的7个SNP显示显著性边际效应(P=1.78×10-39-2.79×10-9)；而另外位于2q22和13q33的2个SNP只以基因-饮酒交互作用方式与食管癌风险增高相关(PG×E=4.39×10-11和PG×E=4.80×10-8)。含乙醇脱氢酶(ADH)基因簇的4q23易感位点与饮酒有显著的交互作用(PG×E=2.54×10-7-3.23×10-2)。我们进一步证实先前报道的12q24(含乙醛脱氢酶2,ALDH2)与食管癌易感性关联,而且进行的合并浅析显示携带ADH1B和ALDH2风险基因型的饮酒者患食管癌风险是携带非风险基因型非饮酒者的4倍。功能实验表明,与食管癌相关的ADH1B3'非翻译区SNP显著影响该基因表达。我们以候选基因对策探讨了细胞因子基因BAFF启动子区SNP rs9514828与T细胞淋巴瘤患者预后的联系。首先在150例T细胞淋巴瘤患者的实验组对rs9514828CT基因型与患者存活时间进行浅析,所获结果在120例T细胞淋巴瘤患者的独立样本中验证。我们用Kaplan-Meier法浅析不同基因型患者的存活时间,用Cox多因素回归浅析与存活相关的独立因素,用双荧光素酶报告基因实验浅析rs9514828SNP的功能。我们发现rs9514828与T细胞淋巴瘤患者存活显著相关。在实验组和验证组合并样本中,rs9514828TC或TT基因型患者5年存活率显著优于CC基因型(47%和53%比22%,log-rank论文导读：
检验P=2.27×105)。Cox回归浅析结果显示,rs9514828SNP与T细胞淋巴瘤患者存活相关,CT和TT基因型的死亡风险比分别为0.48(95%可信区限=0.32-0.71)和0.47(95%可信区限=0.23-0.93)。报告基因实验表明rs9514828T等位基因的启动子活性显著高于rs9514828C等位基因。我们推测rs9514828CT主要影响抗癌的细胞毒性T细胞,清除有害的T细胞淋巴瘤细胞,以而对T细胞淋巴瘤患者起到保护作用,延长患者存活期。上面陈述的发现进一步证明遗传变异在食管癌及T细胞淋巴瘤的发生或进展中起重要作用,对理解食管癌及T细胞淋巴瘤的病因及发病机制有重要帮助,对这两种肿瘤发生进展的预测和个体化防治可能有潜在的运用价值。关键词：食管癌论文T细胞淋巴瘤论文单核苷酸多态论文全基因组关联探讨论文基因-环境交互作用论文易感性论文存活论文
本论文由www.7ctime.com,需要论文可以联系人员哦。表索引4-5
图索引5-6
缩略语表6-7
摘要7-8
ABSTRACT8-9
第一部分9-57
前言10-13
材料与策略13-19
结果19-48
讨论48-51
参考文献51-55
附表55-57
第二部分57-77
前言58-61
材料与策略61-67
结果67-72
讨论72-74
参考文献74-77
文献综述77-94
参考文献87-94
基金资助94-95
致谢95-96
个人简历96-98
摘要：越来越多的探讨证据表明遗传变异在疾病的易感性和发生进展中起重要作用。本探讨以我国常见的食管鳞状细胞癌(简称食管癌)和少见的非霍奇金T细胞淋巴瘤(简称T细胞淋巴瘤)为模型,浅析单核苷酸多态(SNP)对食管癌易感性和对T细胞淋巴瘤预后的影响。对食管癌我们运用全基因组关联探讨(GWAS)对策,对T细胞淋巴瘤我们采取候选基因浅析对策。食管癌全基因组关联探讨包括全基因组筛查、一期验证和二期验证。全基因组筛查和最关联的一些易感位点(P10-7)数据已经报道(Wu et al.,2011)。本探讨在此基础上对10-7P≤104的SNP进行扩大样本量(10,123例食管癌和10,664例正常对照)验证,并进行全基因组基因-饮酒交互作用浅析。我们发现9个新的食管癌易感位点,其中位于4q23、16q12.1、17q21、22q12、3q27、17p13和18p11的7个SNP显示显著性边际效应(P=1.78×10-39-2.79×10-9)；而另外位于2q22和13q33的2个SNP只以基因-饮酒交互作用方式与食管癌风险增高相关(PG×E=4.39×10-11和PG×E=4.80×10-8)。含乙醇脱氢酶(ADH)基因簇的4q23易感位点与饮酒有显著的交互作用(PG×E=2.54×10-7-3.23×10-2)。我们进一步证实先前报道的12q24(含乙醛脱氢酶2,ALDH2)与食管癌易感性关联,而且进行的合并浅析显示携带ADH1B和ALDH2风险基因型的饮酒者患食管癌风险是携带非风险基因型非饮酒者的4倍。功能实验表明,与食管癌相关的ADH1B3'非翻译区SNP显著影响该基因表达。我们以候选基因对策探讨了细胞因子基因BAFF启动子区SNP rs9514828与T细胞淋巴瘤患者预后的联系。首先在150例T细胞淋巴瘤患者的实验组对rs9514828CT基因型与患者存活时间进行浅析,所获结果在120例T细胞淋巴瘤患者的独立样本中验证。我们用Kaplan-Meier法浅析不同基因型患者的存活时间,用Cox多因素回归浅析与存活相关的独立因素,用双荧光素酶报告基因实验浅析rs9514828SNP的功能。我们发现rs9514828与T细胞淋巴瘤患者存活显著相关。在实验组和验证组合并样本中,rs9514828TC或TT基因型患者5年存活率显著优于CC基因型(47%和53%比22%,log-rank论文导读：
检验P=2.27×105)。Cox回归浅析结果显示,rs9514828SNP与T细胞淋巴瘤患者存活相关,CT和TT基因型的死亡风险比分别为0.48(95%可信区限=0.32-0.71)和0.47(95%可信区限=0.23-0.93)。报告基因实验表明rs9514828T等位基因的启动子活性显著高于rs9514828C等位基因。我们推测rs9514828CT主要影响抗癌的细胞毒性T细胞,清除有害的T细胞淋巴瘤细胞,以而对T细胞淋巴瘤患者起到保护作用,延长患者存活期。上面陈述的发现进一步证明遗传变异在食管癌及T细胞淋巴瘤的发生或进展中起重要作用,对理解食管癌及T细胞淋巴瘤的病因及发病机制有重要帮助,对这两种肿瘤发生进展的预测和个体化防治可能有潜在的运用价值。关键词：食管癌论文T细胞淋巴瘤论文单核苷酸多态论文全基因组关联探讨论文基因-环境交互作用论文易感性论文存活论文
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摘要7-8
ABSTRACT8-9
第一部分9-57
前言10-13
材料与策略13-19
结果19-48
讨论48-51
参考文献51-55
附表55-57
第二部分57-77
前言58-61
材料与策略61-67
结果67-72
讨论72-74
参考文献74-77
文献综述77-94
参考文献87-94
基金资助94-95
致谢95-96
个人简历96-98