试谈运用SELDI技术初步筛选肺纤维化生物标记物-

论文导读：肺泡灌洗液标本。2010年1月至2012年2月期间，共纳入特发性肺纤维化患者34例、风湿性关节炎合并间质性肺疾病患者15例、对照组患者25例。将CM10芯片与血清或者支气管肺泡灌洗液标本结合后，通过增强激光解吸电离飞行时间质谱进行检测获得蛋白质指纹图谱，用BiomarkerWizard软件、BiomarkerPattern软件以及Spss1

3.0对测得的数据

摘要：目的：运用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱筛选特发性肺纤维化和类风湿性关节炎合并间质性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液和血清中的差别蛋白，初步建立诊断分类树模型。策略：在我院呼吸科门诊或住院患者中，选取特发性肺纤维化和类风湿性关节炎合并间质性肺疾病患者为实验组，选取胸部影像学正常的咳嗽或胸闷患者作为对照组，该组患者行支气管镜是为了明确诊断，且镜检未见显著异常、支气管肺泡灌洗液细胞学常规检查无嗜酸粒细胞升高。在患者及家属知情同意下，留取血清和支气管肺泡灌洗液标本。2010年1月至2012年2月期间，共纳入特发性肺纤维化患者34例、风湿性关节炎合并间质性肺疾病患者15例、对照组患者25例。将CM10芯片与血清或者支气管肺泡灌洗液标本结合后，通过增强激光解吸电离飞行时间质谱进行检测获得蛋白质指纹图谱，用Biomarker Wizard软件、Biomarker Pattern软件以及Spss13.0对测得的数据进行处理，初步构建分类树模型并随机选取部分病例进行验证。结果：1.CM10芯片和表面加强激光解吸电离飞行时间质谱检测出特发性肺纤维化和对照组患者支气管肺泡灌洗液标本中247个蛋白峰，13个蛋白质峰差别有统计学作用（t检验，P0.05），与对照组相比，质荷比为2240.57、3459.32、3501.78、4146.50、4516.51、4615.88、5651.26表达升高，质荷比为4989.10、5043.68、6968.76、14733.3、11687.7、11782.1表达下降，以质荷比3459.32、4516.51、4989.91、14733.3建立诊断分类树筛选模型灵敏度为91.176%（31/34），特异度为92.0%（23/25），ROC曲线下面积为0.949，随机选取特发性肺纤维化和对照组患者支气管肺泡灌洗液各15例进行验证，模型灵敏度为93.333%（14/15）,特异度为86.667%（13/15）；CM10芯片和表面加强激光解吸电离飞行时间质谱检测出特发性肺纤维化和对照组血清样本中143个蛋白峰，7个蛋白质峰差别有统计学作用（t检验，P0.05），与对照组相比，质荷比3382.59、4806.03、3453.39表达升高，质荷比为5825.48、11525.3、11886.0、11689.4表达下降，以质荷比3453.39、5825.48、11886.0建立诊断分类树筛选模型,灵敏度为94.737%（18/19），特异度为84.615%（11/13），ROC曲线下面积为0.913，随机选取特发性肺纤维化和对照组患者血清各10例进行验证，模型灵敏度为100%（10/10）,特异度为90%（9/10）。特发性肺纤维化患者构建的血清诊断分类树和支气管肺泡灌洗液诊断分类树的灵敏度、特异度、正确率、ROC曲线面积比较，χ~2检验发现P值均大于0.05，无统计学作用。2.CM10芯片和表面加强激光解吸电离飞行时间质谱检测出类风湿性关节炎合并间质性肺疾病患者和对照组血清标本中143个蛋白峰，4个蛋白质峰差别有统计学作用（t检验，P0.05），质荷比分别为2876.75,3382.59,11525.3,11886.0，表达均升高，以质荷比11525.3,2876.75建立诊断分类树，灵敏度为93.333%（14/15），特异度为92.308%（12/13），ROC曲线下面积为0.936，随机选取类风湿性关节炎合并间质性肺疾病和对照组患者血清各10例进行验证，模型灵敏度为90%（9/10）,特异度为90%（9/10）。结论：1.表面加强激光解吸电离飞行时间质谱技术能筛选出了特发性肺纤维化患者支气管肺泡灌洗液和血清差别蛋白，以质荷比3459.32、4516.51、4989.91、14733.3建立支气管肺泡灌洗液分类树模型和以质荷比3453.39、5825.48、11886.0建立血清诊断分类树模型价值均较高，有进一步探讨作用。另外，血清中有着质荷比11689.4、3453.39差别蛋白和支气管肺泡灌洗液中有着质荷比11687.7、3459.32，是否同源值得进一步探讨。2.表面加强激光解吸电离飞行时间质谱技术能筛选出了类风湿性关节炎合并间质性肺疾病血清差别蛋白，以质荷比11525.3,2876.75建立血清诊断分类树建立诊断支气管肺泡灌洗液分类树模型价值较高，有进一步探讨作用。关键词：特发性肺纤维化论文类风湿性关节炎合并间质性肺疾病论文支气管肺泡灌洗液论文血清论文SELDI-TOF-MS论文蛋白质论文
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摘要4-6
ABSTRACT6-9
英文缩写9-10
引言10-11
第一部分 运用 SELDI 技术筛选特发性肺纤维化差别蛋白11-42
前言11
材料与策略11-17
结果17-21
附图21-32
附表32-38
讨论38-40
小结40
参考文献40-42
第二部分 运用 SELDI 技术筛选类风湿性关节炎合并间质性肺疾病差别蛋白42-56
前言42
材料与策略42-45
结果45-47
附图47-51
附表51-53
讨论53-54
小结54
参考文献54-56
结论56-57
综述 蛋白质组学技术在肺部疾病运用及进展57-64
参考文献61-64
致谢64-65
个人简历65