简述鹅掌楸EST

论文导读：记在柳树中的通用性分析;分子植物育种;、姜春芽;廖娇;徐小彪;辜青青;刘善军;陈金印-植物EST-SSR技术及其应用;分子植物育种;、刘公秉;季孔庶-基于松树EST序列的马尾松SSR引物开发;分子植物育种;、邵光金;牛玉;乐素菊;汪文毅;汪国平-茄子SSR标记在番茄上的通用性分析;分子植物育种;、罗冉;吴委林;张旸;李玉花-SSR分子
鹅掌楸EST论文相关文献张立荣,徐大庆,刘大群;SSR和ISSR分子标记及其在植物遗传育种研究中的应用[J];河北农业大学学报;、李红英;李康琴;胥猛;李火根-北美鹅掌楸EST-SSR跨属间通用性[J];东北林业大学学报;、陈树林;王沛政;胡保民-陆地棉EST-SSRs在向日葵中的通用性研究[J];西北植物学报;、张洁;陈学好;张海英-黄瓜遗传图谱研究进展[J];分子植物育种;、胥猛;李火根-鹅掌楸EST-SSR引物开发及通用性分析[J];分子植物育种;、杨彦伶;张亚东;张新叶-杨树SSR标记在柳树中的通用性分析[J];分子植物育种;、姜春芽;廖娇;徐小彪;辜青青;刘善军;陈金印-植物EST-SSR技术及其应用[J];分子植物育种;、刘公秉;季孔庶-基于松树EST序列的马尾松SSR引物开发[J];分子植物育种;、邵光金;牛玉;乐素菊;汪文毅;汪国平-茄子SSR标记在番茄上的通用性分析[J];分子植物育种;、罗冉;吴委林;张旸;李玉花-SSR分子标记在作物遗传育种中的应用[J];基因组学与应用生物学;【共引文献】 中国期刊全文数据库赵传志;李爱芹;李长生;刘波;夏晗;王兴军;贾文斌-山羊EST资源的SSR分析[J];山东农业科学;、段乃彬;王建成;于天祥;孔素萍;李群;张文兰;戴双-高羊茅EST-SSR标记的开发及品种鉴定[J];山东农业科学;、朱少华-杉松生态林下套种杂交鹅掌楸试验研究[J];安徽农学通报(上半月刊);、蔡桁,蒋祥娥,汪建亚,丁小飞,郝汉芳,户田忠雄,锦织正智;鹅掌楸组织培养技术研究[J];安徽农业科学;、田英翠;杨柳青;曹受金-广玉兰在园林景观设计中的应用[J];安徽农业科学;、于新艳;王凤格;赵久然;王玺;匡猛-SSR标记及其在玉米研究中的应用[J];安徽农业科学;、郭大龙-植物微卫星引物开发策略[J];安徽农业科学;、白玉-DNA分子标记技术及其应用[J];安徽农业科学;、陈卓;刘杰;钱万强;孙杰;沈继红;林学政;王能飞-表达序列标签(EST)分析及藻类EST文库的研究进展[J];安徽农业科学;、惠利省;徐立安;王章荣-马褂木不同种源苗期光合特性差异分析[J];安徽农业科学; 吴淑芳;张留伟;蔡伟健;喻正发-杂交鹅掌楸材性、纤维特性及制浆性能研究[A];中国造纸学会第十五届学术年会论文集[C];依赖性蛋白激酶家族(CDK)的研究[D];浙江理工大学;养分吸收QTL定位[D];山东农业大学;刊全文数据库朱美霞;李英芝;王建书;侯英梅;孟艳玲-利用SSR策略鉴定棉花品种纯度[J];安徽农业科学;、黄成志;黄文章;严明建;胡景涛;吕直文;雷树凡;冉彦秀-利用SSR分子标记鉴定杂交水稻真伪与纯度[J];安徽农业科学;、张德强,张志毅,杨凯;杨树分子标记研究进展[J];北京林业大学学报;、张俊卫,包满珠,陈龙清;梅、桃、李、杏、樱的RAPD分析[J];北京林业大学学报;1998年02期、金基强;崔海瑞;陈文岳;卢美贞;姚艳玲;忻雅;龚晓春-茶树EST-SSR的信息分析与标记建立[J];茶叶科学;、姜静,杨传平,刘桂丰,刘玉喜,任旭琴;应用RAPD技术对东北地区白桦种源遗传变异的分析[J];东北林业大学学报;、李周岐,王章荣;马褂木无性系随机扩增加态DNA指纹图谱的构建[J];东北林业大学学报;、刘西俊,周丕振,王淑燕,刘青林,李莲梅;鹅掌楸生理特性及适应性的研究[J];西北植物学报;1989年03期、王亚玲,张寿洲,崔铁成;trnL内含子及trnL-trnF间隔区序列在木兰科系统发育研究中的应用[J];西北植物学报;、王丽,赵桂仿;植物不同种属间共用微卫星引物的研究[J];西北植物学报;【相似文献】 中国期刊全文数据库李小白;崔海瑞;张明龙-EST-SSRs检测油菜(Brassica napus)亲本遗传多样性[J];农业生物技术学报;、石耀华;洪葵;郭希明;王嫣;侯占辉;顾志峰;王爱民-马氏珠母贝EST微卫星的筛选[J];水产学报;、段乃彬;王建成;于天祥;孔素萍;李群;张文兰;戴双-高羊茅EST-SSR标记的开发及品种鉴定[J];山东农业科学;、李武;林忠旭;张献龙-亚洲棉种内群体异常偏分离的分子标记检测(英文)[J];遗传学报;、李晶晶;王述彬;刘金兵;潘宝贵;陈劲枫-辣椒EST-SSR标记的开发[J];分子植物育种;、于林清;刘荣霞;苏东;云锦凤-利用SSR和EST-SSR技术研究不同秋眠级苜蓿遗传多样性[J];中国草地学报;、李杰勤;王丽华;詹秋文;陈亚-高粱EST-SSR标记的建立及其在苏丹草中的应用初探[J];草业科学;、程小毛;陈自兰;王华-茶树EST-SSRs在山茶科植物中的通用性研究(英文)[J];Agricultural Science & Technology;、刘本英;李友勇;孙雪梅;唐一春;贺巍;汪云刚;王平盛-云南茶树资源遗传多样性分析(英文)[J];西北植物学报;、姚明哲;陈亮;马春雷;王新超;梁月荣-ISSR和EST-SSR标记在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种遗传多样性上的比较分析[J];分子植物育种; 周晓丽;刘春生;王学勇;黄璐琦-药用植物EST-SSR的研究进展[A];中华中医药学会第十届中药鉴定学术会议暨WHO中药材鉴定策略和技术研讨会论文集[C];叶芽基因差异表达与优势关系的分析[A];第六届全国林木遗传育种大会论文集[C];
论文目录
致谢3-4
摘要4-5
Abstract5-10
第一章文献综述10-21

1.1DNA分子标记概述10-16

1.1分子标记的主要特征11

1.2分子标记主要类型、原理及特点11-14

1.2.1限制性片段长度多态性（RFLP）标记11-12

1.2.2随机扩增加态性DNA（RAPD）标记12

1.2.3序列标记位点（STS）标记12

1.2.4扩论文导读：

增片段长度多态性（AFLP）标记12-13

1.2.5单核苷酸多态性（SNP）标记13

1.2.6简单序列重复（SSR）标记13-14

1.3理想DNA分子标记的特征14-15

1.4SSR标记的应用15-16

1.4.1构建遗传连锁图谱15

1.4.2分子标记辅助育种15

1.4.3建立DNA指纹图谱15-16

1.4.4遗传多样性的研究16

1.2EST-SSR标记开发及应用16-19

1.2.1EST概述16-17

1.2.2EST-SSR标记开发17

1.2.3EST-SSR标记的特点17-18

1.2.4EST-SSRs标记的应用18-19

1.2.4.1遗传连锁图谱的构建18

1.2.4.2种质资源遗传多样性的研究18-19

1.2.4.3比较作图19

1.3EST-SSR分子标记的通用性研究19-20

1.4本课题研究的目的作用20-21

第二章鹅掌楸转录组测序及EST-SSR分子标记开发21-32

2.1实验材料21

2.2实验策略21-27

2.1鹅掌楸EST-SSR引物的开发21-26

2.2.

1.1RNA提取21-22

2.2.

1.2RNA纯化22

2.2.

1.3RNA质量检测22-23

2.2.

1.4转录组文库制备23

2.2.

1.5文库成簇（clustering）与测序23

2.2.

1.6生物信息学分析23-26

2.2.

1.7鹅掌楸EST-SSR引物筛选26

2.2.2北美鹅掌楸EST-SSR引物的开发26-27

2.1引物设计原则26

2.2SSR引物选取原则26-27

2.3北美鹅掌楸EST-SSR引物开发27

2.3引物稀释27

2.3结果与分析27-31

2.3.1鹅掌楸花瓣和叶片RNA的提取27-28

2.3.2原始测序序列（Rawreads）结果分类28

2.3.3测序数据质量汇总28

2.3.4拼接转录本长度分布28-29

2.3.5SSR分析29

2.3.6鹅掌楸EST-SSR引物的开发29-31

2.3.7北美鹅掌楸EST-SSR引物设计31

2.4讨论31-32

2.4.1RNA的提取31

2.4.2生物信息学软件的应用31-32

第三章利用北美鹅掌楸EST-SSR分子标记检测鹅掌楸天然群体的遗传多样性32-43

3.1实验材料32

3.2实验策略32-37

3.

2.1鹅掌楸属树种总DNA的提取与纯化32-33

3.2.

1.1DNA粗提32-33

3.2.

1.2DNA纯化33

3.2.2DNA质量的检测33-34
3.

2.3SSR引物筛选与PCR扩增反应34-35

3.

2.4PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测35-36

3.

2.4.1电泳和银染步骤各试剂和溶液的配制35

3.

2.4.2聚丙烯酰胺凝胶电泳过程35-36

3.

2.4.3银染检测步骤36

3.

2.5条带判读与统计分析36-37

3.3结果与分析37-41

3.1北美鹅掌楸EST-SSR引物的PCR扩增结果与多态性分析37

3.2广西猫儿山鹅掌楸天然群体的遗传多样性分析37-41

3.4讨论41-43

3.4.1PCR扩增产物的判读41

3.4.2北美鹅掌楸EST-SSR引物的多态性分析41-42

3.4.3鹅掌楸天然群体的遗传多样性分析42-43

第四章鹅掌楸EST-SSR跨属间通用性分析43-52

4.1实验材料43-44

4.2实验策略44-46

4.

2.1木兰科植物DNA的提取与纯化44

4.

2.2鹅掌楸EST-SSR引物多态性检测44

4.

2.3鹅掌楸EST-SSR引物跨属间的通用性分析44-45

4.

2.4条带判读与统计分析45-46

4.3结果与分析46-50
4.

3.1鹅掌楸SSR引物的多态性筛选及在属内的通用性分析46-47

4.

3.2鹅掌楸EST-SSR引物的跨属间通用性分析47-50

4.4讨论50-52

4.1SSR-PCR反应体系的优化50

4.2鹅掌楸EST-SSR引物的多态性分析50

4.3鹅掌楸EST-SSR引物的跨属间通用性分析50-51

4.4鹅掌楸EST-SSR引物的进一步分析51-52

第五章主要研究结论与进一步研究展望52-54

5.1主要研究结论52-53

5.

1.1鹅掌楸属树种EST-SSR分子标记的开发52

5.

1.2利用北美鹅掌楸EST-SSR分子标记检测鹅掌楸天然群体遗传多样性52

5.

1.3鹅掌楸EST-SSR引物的多态性检测及通用性分析52-53

5.2进一步研究展望53-54
5.

2.1鹅掌楸EST-SSR引物的进一步分析53

5.

2.2EST-SSR引物在木兰科植物中的研究展望53-54

参考文献54-57
鹅掌楸属转录组EST-SSR多态性通用性
参考文献
于红;牡蛎良种选育的遗传学基础研究[D];中国海洋大学;依赖性蛋白激酶家族(CDK)的研究[D];浙江理工大学;养分吸收QTL定位[D];山东农业大学;刊全文数据库朱美霞;李英芝;王建书;侯英梅;孟艳玲-利用SSR策略鉴定棉花品种纯度[J];安徽农业科学;、黄成志;黄文章;严明建;胡景涛;吕直文;雷树凡;冉彦秀-利用SSR分子标记鉴定杂交水稻真伪与纯度[J];安徽农业科学;、张德强,张志毅,杨凯;杨树分子标记研究进展[J];北京林业大学学报;、张俊卫,包满珠,陈龙清;梅、桃、李、杏、樱的RAPD分析[J];北京林业大学学报;1998年02期、金基强;崔海瑞;陈文岳;卢美贞;姚艳玲;忻雅;龚晓春-茶树EST-SSR的信息分析与标记建立[J];茶叶科学;、姜静,杨传平,刘桂丰,刘玉喜,任旭琴;应用RAPD技术对东北地区白桦种源遗传变异的分析[J];东北林业大学学报;、李周岐,王章荣;马褂木无性系随机扩增加态DNA指纹图谱的构建[J];东北林业大学学报;、刘西俊,周丕振,王淑燕,刘青林,李莲梅;鹅掌楸生理特性及适应性的研究[J];西北植物学报;1989年03期、王亚玲,张寿洲,崔铁成;trnL内含子及trnL-trnF间隔区序列在木兰科系统发育研究中的应用[J];西北植物学报;、王丽,赵桂仿;植物不同种属间共用微卫星引物的研究论文导读：样性上的比较分析;分子植物育种;周晓丽;刘春生;王学勇;黄璐琦-药用植物EST-SSR的研究进展;中华中医药学会第十届中药鉴定学术会议暨WHO中药材鉴定策略和技术研讨会论文集;叶芽基因差异表达与优势关系的分析;第六届全国林木遗传育种大会论文集;测定;南京林业大学;、潘文婷;鹅掌楸近交衰退的SSR分析;南京林业大学;、李
[J];西北植物学报;【相似文献】 中国期刊全文数据库李小白;崔海瑞;张明龙-EST-SSRs检测油菜(Brassica napus)亲本遗传多样性[J];农业生物技术学报;、石耀华;洪葵;郭希明;王嫣;侯占辉;顾志峰;王爱民-马氏珠母贝EST微卫星的筛选[J];水产学报;、段乃彬;王建成;于天祥;孔素萍;李群;张文兰;戴双-高羊茅EST-SSR标记的开发及品种鉴定[J];山东农业科学;、李武;林忠旭;张献龙-亚洲棉种内群体异常偏分离的分子标记检测(英文)[J];遗传学报;、李晶晶;王述彬;刘金兵;潘宝贵;陈劲枫-辣椒EST-SSR标记的开发[J];分子植物育种;、于林清;刘荣霞;苏东;云锦凤-利用SSR和EST-SSR技术研究不同秋眠级苜蓿遗传多样性[J];中国草地学报;、李杰勤;王丽华;詹秋文;陈亚-高粱EST-SSR标记的建立及其在苏丹草中的应用初探[J];草业科学;、程小毛;陈自兰;王华-茶树EST-SSRs在山茶科植物中的通用性研究(英文)[J];Agricultural Science & Technology;、刘本英;李友勇;孙雪梅;唐一春;贺巍;汪云刚;王平盛-云南茶树资源遗传多样性分析(英文)[J];西北植物学报;、姚明哲;陈亮;马春雷;王新超;梁月荣-ISSR和EST-SSR标记在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种遗传多样性上的比较分析[J];分子植物育种; 周晓丽;刘春生;王学勇;黄璐琦-药用植物EST-SSR的研究进展[A];中华中医药学会第十届中药鉴定学术会议暨WHO中药材鉴定策略和技术研讨会论文集[C];叶芽基因差异表达与优势关系的分析[A];第六届全国林木遗传育种大会论文集[C];测定[D];南京林业大学;、潘文婷;鹅掌楸近交衰退的SSR分析[D];南京林业大学;、李明卫;大型真菌黑松露EST-SSR信息分析[D];浙江农林大学;、陈琛;甘蓝EST-SSR标记开发及应用[D];青岛农业大学;