浅析舟山岛我国小鲵线粒体基因组与小鲵科系统发育

论文导读：峰;孔祥淮;李军-黄东海陆架及朝鲜海峡泥质沉积物的磁学特征比较研究;第四纪研究;、曾晓茂,费梁,叶昌媛,江建平;三种小鲵和极北鲵的核型;动物学研究;1997年03期、田应洲,谷晓明;贵州两种拟小鲵乳酸脱氢酶同工酶(LDH)的电泳分析;贵州科学;、汪豫忠;舟山群岛地区的地质构造背景;华南地震;1995年01期、王一虎,王秀玲,方盛
舟山岛的我国小鲵线粒体基因组与小鲵科的系统发育论文相关文献熊建利;朱文文;孙平-小鲵科中国特有属及物种组成[J];安徽农业科学;、Jinzhong FU,Mark HAYES,刘志君,曾晓茂;中国西南部小鲵属的遗传分化(英文)[J];动物学报;、李悦,吴敏,王秀玲;小鲵科线粒体16S rRNA基因序列分析及其系统发育[J];动物学报;、宋鸣涛,左华;秦岭地区的山溪鲵[J];动物学杂志;1983年04期、陈晓虹,王林嵩,瞿文元;河南省小鲵科两种动物酯酶、过氧化物酶同工酶的比较研究[J];动物学杂志;、刘健;秦华峰;孔祥淮;李军-黄东海陆架及朝鲜海峡泥质沉积物的磁学特征比较研究[J];第四纪研究;、曾晓茂,费梁,叶昌媛,江建平;三种小鲵和极北鲵的核型[J];动物学研究;1997年03期、田应洲,谷晓明;贵州两种拟小鲵乳酸脱氢酶同工酶(LDH)的电泳分析[J];贵州科学;、汪豫忠;舟山群岛地区的地质构造背景[J];华南地震;1995年01期、王一虎,王秀玲,方盛国,吴敏;两栖类小鲵科不同属多个体DNA指纹图谱分析及其分类理由探讨[J];浙江大学学报(理学版);【共引文献】 中国期刊全文数据库李玉文;刘青杰-线粒体基因表达的影响因素及其在肿瘤细胞中的表达[J];癌变.畸变.突变;、张毅川,陈亮明,乔丽芳,姚连芳;城市化进程中的景观资源及其保护——以河南省新乡市为例[J];安徽农业科学;、彭仁海;刘玉玲-商城肥鲵的含肉率及其肌肉生化成分分析[J];安徽农业科学;、曾小飚;苏仕林-广西地州自然保护区两栖爬行动物资源调查与评价[J];安徽农业科学;、徐敬明-斑腿树蛙消化道组织学的初步研究[J];安徽农业科学;、侯江;刘克志-重庆合川市陆生野生脊椎动物资源调查报告[J];安徽农业科学;、熊建利;朱文文;孙平-小鲵科中国特有属及物种组成[J];安徽农业科学;、沈莹;左成学;吴敏;王星果;张营;徐建荣;顾志良-赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6基因克隆及序列特征分析[J];安徽农业科学;、徐宁;张景涿-安龙仙鹤坪斑腿泛树蛙的形态特征研究[J];安徽农业科学;、漆朝晖;龚大洁;吴洪超;候峰-中药材西藏山溪鲵再考证[J];安徽农业科学; 中国博士学位论文全文数据库董晓丽;半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）线粒体基因组全序列和性别相关基因的克隆与表达分析[D];中国海洋大学;的生境选择与种群动态研究[D];中南林业科技大学;刊全文数据库刘承钊,胡淑琴,杨抚华;四川巫山两棲类初步调查报告[J];动物学报;1960年02期、胡椒琴,赵尔宓,刘承钊;秦岭及大巴山地区两栖爬行动物调查报告[J];动物学报;1966年01期、徐晋麟,马学海;黑爪异鲵LDH同工酶谱系的研究[J];动物学报;1996年02期、谷晓明,田应洲;贵州四种蝾螈科动物的核型和C-带比较研究[J];动物学报;、江建平,周开亚;从12SrRNA基因序列研究中国蛙科24种的进化关系[J];动物学报;、张四明,吴清江,张亚平;从线粒体DNA制约区核苷酸序列论达式鲟、亚洲和北美洲中吻鲟的分类地位(英文)[J];动物学报;、杨光,任文华,钮明华,周开亚;条纹原海豚mtDNA制约区序列变异分析[J];动物学报;、侯鹏,卫明,张立勋,刘迺发;大石鸡边缘种群的遗传结构[J];动物学报;、季国庆,杨光,刘珊,周开亚;中国水域瓶鼻海豚的mtDNA制约区序列变异性分析[J];动物学报;、李庆伟,李爽,田春宇,军,郭玉梅;雀形目10种鸟类线粒体的DNA变异及分子进化[J];动物学报;【相似文献】 中国期刊全文数据库王一虎,王秀玲,方盛国,吴敏;两栖类小鲵科不同属多个体DNA指纹图谱分析及其分类理由探讨[J];浙江大学学报(理学版);、李峰;我国隐鳃鲵科、小鲵科、蝾螈科卵的比较[J];生物学通报;1998年10期、李悦,吴敏,王秀玲;小鲵科线粒体16S rRNA基因序列分析及其系统发育[J];动物学报;、田应洲,谷晓明,孙爱群,李松;贵州省拟小鲵属(有尾目:小鲵科)一新种——水城拟小鲵[J];六盘水师范高等专科学校学报;1998年04期、费梁,瞿文元,吴淑辉;我国小鲵科一新属新种的描述[J];动物学研究;1985年04期、熊建利;孙平;朱文文;刘秀英-我国特有的小鲵科动物——商城肥鲵[J];畜牧与饲料科学;、陈晓虹,瞿文元,牛红星;中国小鲵属一新种(两栖纲:有尾目:小鲵科)[J];动物分类学报;、陈晓虹;杨杰;瞿文元-秦巴拟小鲵在河南的发现及地理分布探讨[J];动物学杂志;、江辉,陈开健,佘曙明,刘建波,林曙,苏建民,徐灿,肖业雄;疑似新种——花垣小鲵的形态和性腺组织学观察[J];湖南农业大学学报(自然科学版);、熊建利;朱文文;孙平-小鲵科中国特有属及物种组成(英文)[J];Agricultural Science & Technology; 前4条 夏云;顾海丰;彭锐;陈勤;郑渝池;Robert W.Murphy;曾晓茂-COI与16S在小鲵科DNA条形码中应用[A];四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会论文集[C];、覃丽梅;郑中华;谢锋;江建平-西藏山溪鲵精子形态研究[A];四川省动物学会第八次会员代表大会暨第九次学术年会论文集[C];、郑中华;江建平;谢锋;刘炯宇-有尾两栖动物精子核脊的结构和功能[A];中国细胞生物学学会学术大会、青年学术研讨会论文摘要集[C];、陈月琴;张鹏;王宁;王秀玲;屈良鹄-新疆北鲵的分子特征及进化生物学研究[A];全国生物进化理论研讨会论文与论文摘要集[C];
论文目录
摘要8-10
ABSTRACT10-12
目录12-14
第一章文献综述14-25

1.1生物进化思想、支序分类学、分子系统学与系统树的重建14-17

1.1.1生物进化思想与理论的发展过程简介14论文导读：发育分析37-383.2基于Cytb基因的小鲵科系统发育分析38-403.2.1Cytb基因数据的获得38-403.2.2Cytb基因序列比对403.2.3基于Cytb基因的小鲵科系统发育关系分析403.3小鲵科分歧时间估算40-413.4实验结果41-473.4.1小鲵科物种的遗传距离分析41-433.4.2基于线粒体基因组的小鲵科的系统发育关系43-443.4.3基于Cytb基因的小鲵科的系

1.2支序分类学14-15

1.3分子系统学15-16

1.4系统发育树的重建策略16-17

1.2小鲵科的分类地位、生活习性和地理分布、分类学研究历史17-19

1.2.1小鲵科的分类地位17

1.2.2小鲵科物种的生活习性和地理分布17

1.2.3小鲵科物种的分类学研究历史概况17-18

1.2.4中国小鲵的发现及形态描述18-19

1.2.5舟山岛的中国小鲵19

1.3线粒体基因组概述19-24

1.3.1线粒体基因组结构19-21

1.3.2线粒体基因组作为分子标记的特点21

1.3.3线粒体基因组在小鲵科系统发育研究中的应用21-24

1.4本研究的目的及作用24-25

第二章中国小鲵线粒体基因组结构分析25-35

2.1实验材料和仪器25-26

2.

1.1实验材料25

2.

1.2主要仪器25

2.

1.3主要试剂25-26

2.

1.4缓冲液和主要试剂26

2.2实验策略26-30

2.1样品DNA的提取26-27

2.2扩增引物的设计27-28

2.CR反应28

2.4PCR产物纯化及克隆测序28-29

2.5序列拼接、注释29-30

2.3实验结果30-33

2.4讨论33-35

第三章小鲵科系统发育关系重建及分歧时间估计35-53

3.1基于线粒体基因组的小鲵科系统发育分析35-38

3.

1.1线粒体基因组数据的获得35-37

3.

1.2线粒体基因组序列收集和比对37

3.

1.3基于线粒体基因组的系统发育分析37-38

3.2基于Cytb基因的小鲵科系统发育分析38-40
3.

2.1Cytb基因数据的获得38-40

3.

2.2Cytb基因序列比对40

3.

2.3基于Cytb基因的小鲵科系统发育关系分析40

3.3小鲵科分歧时间估算40-41

3.4实验结果41-47

3.4.1小鲵科物种的遗传距离分析41-43

3.4.2基于线粒体基因组的小鲵科的系统发育关系43-44

3.4.3基于Cytb基因的小鲵科的系统发育关系44-46

3.4.4小鲵科的分歧时间分析46-47

3.5讨论47-53

3.5.1小鲵科系统发育关系与起源探讨47-49

3.5.2小鲵科同物异名及隐存种理由的探讨49-50

3.5.3舟山的中国小鲵的分类地位与起源50-53

结论53-54
参考文献54-60
致谢60-61
在读期间发表的学术论文及研究成果61
中国小鲵线粒体基因组系统发育关系分子钟
参考文献
董晓丽;半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）线粒体基因组全序列和性别相关基因的克隆与表达分析[D];中国海洋大学;的生境选择与种群动态研究[D];中南林业科技大学;刊全文数据库刘承钊,胡淑琴,杨抚华;四川巫山两棲类初步调查报告[J];动物学报;1960年02期、胡椒琴,赵尔宓,刘承钊;秦岭及大巴山地区两栖爬行动物调查报告[J];动物学报;1966年01期、徐晋麟,马学海;黑爪异鲵LDH同工酶谱系的研究[J];动物学报;1996年02期、谷晓明,田应洲;贵州四种蝾螈科动物的核型和C-带比较研究[J];动物学报;、江建平,周开亚;从12SrRNA基因序列研究中国蛙科24种的进化关系[J];动物学报;、张四明,吴清江,张亚平;从线粒体DNA制约区核苷酸序列论达式鲟、亚洲和北美洲中吻鲟的分类地位(英文)[J];动物学报;、杨光,任文华,钮明华,周开亚;条纹原海豚mtDNA制约区序列变异分析[J];动物学报;、侯鹏,卫明,张立勋,刘迺发;大石鸡边缘种群的遗传结构[J];动物学报;、季国庆,杨光,刘珊,周开亚;中国水域瓶鼻海豚的mtDNA制约区序列变异性分析[J];动物学报;、李庆伟,李爽,田春宇,军,郭玉梅;雀形目10种鸟类线粒体的DNA变异及分子进化[J];动物学报;【相似文献】 中国期刊全文数据库王一虎,王秀玲,方盛国,吴敏;两栖类小鲵科不同属多个体DNA指纹图谱分析及其分类理由探讨[J];浙江大学学报(理学版);、李峰;我国隐鳃鲵科、小鲵科、蝾螈科卵的比较[J];生物学通报;1998年10期、李悦,吴敏,王秀玲;小鲵科线粒体16S rRNA基因序列分析及其系统发育[J];动物学报;、田应洲,谷晓明,孙爱群,李松;贵州省拟小鲵属(有尾目:小鲵科)一新种——水城拟小鲵[J];六盘水师范高等专科学校学报;1998年04期、费梁,瞿文元,吴淑辉;我国小鲵科一新属新种的描述[J];动物学研究;1985年04期、熊建利;孙平;朱文文;刘秀英-我国特有的小鲵科动物——商城肥鲵[J];畜牧与饲料科学;、陈晓虹,瞿文元,牛红星;中国小鲵属一新种(两栖纲:有尾目:小鲵科)[J];动物分类学报;、陈晓虹;杨杰;瞿文元-秦巴拟小鲵在河南的发现及地理分布探讨[J];动物学杂志;、江辉,陈开健,佘曙明,刘建波,林曙,苏建民,徐灿,肖业雄;疑似新种——花垣小鲵的形态和性腺组织学观察[J];湖南农业大学学报(自然科学版);、熊建利;朱文文;孙平-小鲵科中国特有属及物种组成(英文)[J];Agricultural Science & Technology; 前4条 夏云;顾海丰;彭锐;陈勤;郑渝池;Robert W.Murphy;曾晓茂-COI与16S在小鲵科DNA条形码中应用[A];四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会论文集[C];生境特征研究[D];浙江师范大学;