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谈述基于mtDNA全基因组我国近海乌贼科系统发生关系

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论文导读:
基于mtDNA全基因组我国近海乌贼科的系统发生关系论文相关文献叶维萍,黄原;长PCR技术及其在动物学研究中的应用[J];动物学杂志;、蒋霞敏;彭瑞冰;罗江;高秀芝;姜小敏-野生拟目乌贼不同组织营养成分分析及评价[J];动物营养学报;、蔡文飞;徐海洪;陈道海-温度对拟目乌贼幼体日生长率和存活率的影响[J];氨基酸和生物资源;、徐海洪;蔡文飞;周淑进;涂华艺;陈道海-拟目乌贼幼体日摄食量及其对体重影响[J];氨基酸和生物资源;、尚娜;周志军-动物线粒体基因组全序列测定的研究策略[J];河池学院学报;、柳淑芳;吴仁协;朱玲;庄志猛-小黄鱼(Larimichthys polyactis)线粒体基因组结构与特征[J];海洋与湖沼;、任亮,苏玉虹,巴彩凤,刘孝刚;PCR引物设计技巧[J];现代畜牧兽医;、鲁成,刘运强,廖顺尧,李斌,向仲怀,韩华,王学刚;家蚕线粒体基因组全序列测定与分析[J];农业生物技术学报;、刘必林;陈新军-头足类生殖系统及其在分类学上的应用[J];水产学报;、郑仲承;寡核苷酸的优化设计[J];生命的化学; 中国博士学位论文全文数据库前2条 时伟;应用线粒体全序列研究鲽形目鱼类的分子系统关系及演化[D];中国海洋大学;刊全文数据库陈复生,付承玉,汪泰初;动物线粒体基因分子系统学研究进展[J];安徽农业科学;、张毅川,陈亮明,乔丽芳,姚连芳;城市化进程中的景观资源及其保护——以河南省新乡市为例[J];安徽农业科学;、梁锦锋;于红卫;叶国平-植物新基因克隆策略和技术进展[J];安徽农业科学;、李忠炉;卢伙胜;凌文通;谢伊丽;刘波-南海北部金线鱼和深水金线鱼的鳞片年轮特征比较研究[J];安徽农业科学;、邓强;王春晓;鲁建章;朱政;刘承初;刘景晶-牛乳铁蛋白抗菌肽(Lactoferricin)基因的克隆与表达质粒构建[J];安徽农业科学;、徐振彪;宋林霞-中国鸡种线粒体研究概况[J];安徽农业科学;、马之明;徐实怀;陈怡飚;贾晓平;吴文杰-真蛸肌肉营养成分及氨基酸含量分析[J];安徽农业科学;、李爱玲-昆虫线粒体DNA在分子进化研究中的应用[J];安徽农业科学;、康发亮-蜱分类的策略及我国蜱分类的研究进展[J];安徽农业科学;、尤超;赵大球;梁乘榜;周春华-PCR引物设计策略综述[J];现代农业科技; 前8条 沈长春;刘勇-东海区乌贼数量分布及其群体组成[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(下册)[C];间河北省海洋渔业增殖放流目前状况与存在的理由[A];中国水产学会渔业资源与环境分会刊全文数据库李明,王小明,盛和林,玉手英利,增田隆一,永田纯子,大泰司纪之;四种鹿属动物的线粒体DNA差异和系统进化关系研究[J];动物学报;1999年01期、王义权,周开亚,徐珞珊,杨光,徐国钧;几种游蛇的Cyt b基因片段序列分析及其演化关系(英文)[J];动物学报;1999年03期、廖顺尧,刘运强,鲁成,周泽扬,向仲怀;家蚕线粒体ND2、COⅠ和若干tRNA基因的克隆及序列分析[J];动物学报;、施燕峰,单祥年,李健,张晓梅,张海军;赤麂线粒体全基因组的序列和结构[J];动物学报;、张颖;聂刘旺;宋娇莲-缅甸陆龟线粒体全基因组的测序及分析[J];动物学报;、郭金虎,余多慰,赵清良,张晓琼,李华,单祥年;应用显微操作和PCR技术进行基因的染色体定位[J];动物学杂志;、张锁链,布赫,仓明,旭日干;牛冷冻试管胚胎性别鉴定的应用[J];动物学杂志;、叶维萍,黄原;长PCR技术及其在动物学研究中的应用[J];动物学杂志;、刘念;胡婧;黄原-应用长PCR扩增蝗虫线粒体全基因组[J];动物学杂志;、王亚明,周开亚;PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用[J];动物学杂志;1996年03期 中国博士学位论文全文数据库前2条 彭作刚;欧亚大陆鲇形目鱼类系统发育与骨鳔下区鱼类分化时间估计及其起源与演化过程研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);刊全文数据库何泽,陈淼,郑小坚,曹广力,薛仁宇,贡成良;中国野桑蚕mtDNA COⅡ-ATPase 6基因区域的序列测定及分析[J];苏州大学学报(工科版);、赵邦悌,朱祯,马树义,沈同;北京鸭肝脏线粒体DNA 2.b的EcoRI/BamHI片段的分子克隆[J];遗传学报;1984年06期、兰宏,熊习昆,林世英,刘爱华,施立明;云南黄牛和大额牛的mtDNA多态性研究[J];遗传学报;1993年05期、王述宇,赵建阳,彭进,蔡引凤,杨建辉,成国祥;利用mtDNA进行波尔山羊品种鉴定初报[J];中国草食动物;、冯国宏,程文,陆师义;玉米黑粉菌mtDNA的研究Ⅱ.限制性内切酶酶切图谱[J];遗传学报;1991年05期、孙允明,吴鹤龄;几种鸟类mt DNA限制性酶切图谱的比较研究[J];畜牧兽医学报;1993年06期、秦春圃;南阳黄牛mtDNA D-100p序列多态性分析结果[J];生物技术通报;、张四明,邓怀,汪登强,张亚平,吴清江;中华鲟(Acipenser sinensis)间的长度变异与个体内的长度异质性[J];遗传学报;1999年05期、魏爱泓,徐虹;分子生物学技术在水产领域的应用[J];水产养殖;、廖剑华,王泽生,陈美元,李洪荣,卢政辉;双孢蘑菇mtDNA粗提物的酶切分析[J];食用菌学报; 慈海鑫;蔡振媛;林恭华;唐利洲;苏建平-高原鼠兔(Ochotona curzoniae)基于线粒体DNA(mtDNA)序列的种群遗传结构[A];野生动物生态与资源保护第四届全国学术研讨会论文摘要集[C];、邵韵平-线粒体DNA突变对衰老的影响[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];、曹洋;贾东论文导读:
涛;万立华;黄映雪;胡淑辉-运用固定寡核苷酸探针杂交检测人类mtDNA HVI区碱基变异[A];中国法医学最新科研与实践(二)——全国第七次法医学术交流会论文精选[C];、徐怀亮;姚永芳;钟丽菁;刘家斌;李萍;陈德敏;李佳薏;倪庆永;简宏波;周亮-峨眉山藏酋猴mtDNA制约区序列变异及种群遗传多样性[A];第七届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会论文摘要集[C];、查代明;杨福合;张兆刚;邢秀梅-利用mtDNA序列鉴定动物物种研究进展[A];、雷雪芹;徐廷生;闫义清;李振红-河南地方鸡种mtDNA的遗传多样性及其进化关系分析[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];、雷初朝;张永德;陈宏;范光丽-朱鹮人工饲养种群mtDNA D-loop序列多态性分析[A];全国首届动物生物技术学术研讨会论文集[C];、廖剑华;王泽生;陈美元;李洪荣;卢政辉-双孢蘑菇mtDNA粗提物的酶切分析[A];全国第6届食用菌学术研讨会论文集[C];、孔庆鹏;姚永刚;孙昌;Hans-Ju rgen Bandelt;朱春龄;张亚平-基于全序列的东亚人群mtDNA系统发育及汉族人群的遗传分化研究[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];、王立铭;刘克健;郑白羽;杜泓;张忱宏;郝彤辉-人类生物硬组织mtDNA—D环区序列分析在法医学中的应用[A];中国法医学最新科研与实践(二)——全国第七次法医学术交流会论文精选[C];
论文目录
摘要8-10
ABSTRACT10-15
第一章前言15-29

1.1乌贼科研究概况15-18

1.1乌贼科分类地位15-16

1.2虎斑乌贼16

1.3刺乌贼16

1.4拟目乌贼16

1.5无针乌贼16-17

1.6乌贼科分类鉴定策略17-18

1.2线粒体基因组研究18-23

1.2.1线粒体基因组概述18

1.2.2线粒体基因组结构与特征18-21

1.2.3线粒体基因组全序列的测序策略21-22

1.2.4线粒体基因组的优点22-23

1.3分子系统学概述23-28

1.3.1分子系统学的定义及发展23-24

1.3.2分子系统学研究步骤24

1.3.3头足类分子系统学发展历程24-26

1.3.4线粒体基因组在乌贼科分子系统学中的应用26-28

1.4本研究主要内容、目的和作用28-29

1.4.1本研究的主要内容28

1.4.2本研究的目的和作用28-29

第二章四种乌贼线粒体全基因组的测定及结构分析29-86

2.1材料与试剂29-32

2.

1.1实验材料29-30

2.

1.2仪器与试剂30-32

2.2实验策略32-38

2.1基因组DNA的提取32-33

2.2基因组DNA的检测33-34

2.3引物设计34

2.4PCR扩增34-36

2.5PCR产物的纯化36

2.6目的片段测序36-37

2.7线粒体全基因组的序列拼接、注释与分析37-38

2.3结果与分析38-47

2.3.1物种鉴定结果38-40

2.3.2DNA提取结果40

2.3.3引物设计结果40-45

2.3.4PCR扩增结果45-47

2.4虎斑乌贼线粒体基因组全序列47-56

2.4.1线粒体基因组结构与特征47-51

2.4.2蛋白质编码基因51-52

2.4.3tRNA基因52-55

2.4.4rRNA基因55

2.4.5非编码区55-56

2.5刺乌贼线粒体基因组全序列56-65

2.5.1线粒体基因组结构与特征56-59

2.5.2蛋白质编码基因59-61

2.5.3tRNA基因61-64

2.5.4rRNA基因64

2.5.5非编码区64-65

2.6拟目乌贼线粒体基因组全序列65-74

2.6.1线粒体基因组结构与特征65-69

2.6.2蛋白质编码基因69-70

2.6.3tRNA基因70-73

2.6.4rRNA基因73

2.6.5非编码区73-74

2.7无针乌贼线粒体基因组全序列74-83

2.7.1线粒体基因组结构与特征74-78

2.7.2蛋白质编码基因78-79

2.7.3tRNA基因79-82

2.7.4rRNA基因82

2.7.5非编码区82-83

2.8讨论83-86

2.8.1线粒体基因组全序列比较基因组学研究83

2.8.2基因间隔与重叠比较基因组学研究83

2.8.3碱基使用情况比较基因组学研究83-84

2.8.4蛋白质编码基因比较基因组学研究84

2.8.5tRNA二级结构比较基因组学研究84-85

2.8.6rRNA比较基因组学研究85

2.8.7非编码区比较基因组学研究85-86

第三章基于线粒体全基因组的乌贼科系统发育分析86-98

3.1材料与策略86-88

3.

1.1外群的选择86

3.

1.2数据的来源86-87

3.

1.3序列的比对87

3.

1.4系统发生树的构建87-88

3.2结果与分析88-95
3.2.1最大似然法(MaximumLikelihoodmethod,ML)构树88-90
3.

2.2邻接法(NeighborJoiningmethod,NJ)构树90-91

3.2.3最小进化法(MinimumEvolutionmethod,ME)构树91-93
3.2.4最大简约法(MaximumParsimonymethod,MP)构树93-95

3.3讨论95-98

结论98-100
参考文献100-109
致谢109-110
在读期间发表的学术论文及研究成果110
乌贼科线粒体基因组结构特征比较基因组学系统进化
参考文献
前2条 时伟;应用线粒体全序列研究鲽形目鱼类的分子系统关系及演化[D];中国海洋大学;刊全文数据库陈复生,付承玉,汪泰初;动物线粒体基因分子系统学研究进展[J];安徽农业科学;、张毅川,陈亮明,乔丽芳,姚连芳;城市化进程中的景观资源及其保护——以河南省新乡市为例[J];安徽农业科学;、梁锦锋;于红卫;叶国平-植物新基因克隆策略和技术进展[J];安徽农业科学;、李忠炉;卢伙胜;凌文通;谢伊丽;刘波-南海北部金线鱼和深水金线鱼的鳞片年轮特征比较研究[J];安徽农业论文导读:基因组的序列和结构;动物学报;、张颖;聂刘旺;宋娇莲-缅甸陆龟线粒体全基因组的测序及分析;动物学报;、郭金虎,余多慰,赵清良,张晓琼,李华,单祥年;应用显微操作和PCR技术进行基因的染色体定位;动物学杂志;、张锁链,布赫,仓明,旭日干;牛冷冻试管胚胎性别鉴定的应用;动物学杂志;、叶维萍,黄原;长PCR技术及其在动物学研究
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