试述多态性B及T淋巴细胞弱化因子(BTLA)基因多态性与黑龙江省妇女乳腺癌发病风险试验
最后更新时间:2024-02-11
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论文导读:析30-314、结果31-494.1试剂盒提取全血基因组DNA结果31-324.2SNP在BTLA基因中位置结构示意图32-334.3BTLA基因SNP位点基因型检测结果33-384.3.1SNP位点PCR结果33-354.3.2限制性内切酶酶切PCR产物结果35-384.4BTLA基因多态性检测统计学结果38-454.4.1Hardy-Weinberg平衡检测384.4.2乳腺癌患者和对照人群基
摘要:目的:B及T淋巴细胞弱化因子(BTLA)是免疫协同刺激分子中的一种免疫抑制性受体,其功能是通过传递抑制信号阻止淋巴细胞的活化。本实验检测B及T淋巴细胞弱化因子基因多态性与中国黑龙江省妇女散发性乳腺癌发病风险间的相关性。策略:本实验运用限制片段长度多态性聚合酶链式反应(PCR-RFLP)及两对相对引物聚合酶链式反应(PCR-CTPP)对中国黑龙江省592例无血缘联系的妇女散发性乳腺癌患者和506例相同地区的正常女性对照者BTLA基因的内含子(1rs1844089,rs2705535),内含子(2rs2633562,rs2931761)及外显子(4rs9288952)的五个多态性位点进行病例对照探讨和基因型检测。计算BTLA基因五个多态性位点的基因型频率和等位基因频率,检测结果运用统计学软件EXCEL和SPSS计算Χ2,优势比(OR)值及95%可信区间(95%CI)值。单体型检测运用Haploview软件。Chromas软件处理DNA测序结果。结果:BTLA基因五个检测位点符合Hardy-Weinberg平衡。在BTLA基因多态检测中,rs1844089CT基因型和rs2705535的AG基因型两个杂合子在患者中频率高于正常人(P=0.0164;P=0.0031),而rs1844089CC,rs2705535GG和rs9288952CC三种纯合子基因型在患者中比率却偏低(P=0.0483;P=0.0098;P=0.0400)。在各种临床联系的指标检测上,我们发现BTLA基因中5个SNP位点的基因多态性与肿瘤大小,雌激素受体(ER),孕激素受体(PR),C-erbB-2及P53都有着相关性。而在淋巴结转移中,我们未发现相关多态位点。在单体型检测中,单体型组合CAAAT在患者中比率较高(P=0.012)。与肿瘤大小,雌激素受体(ER),孕激素受体(PR)及P53相关的单体型分别为CAGAT(P=0.012),TAAGT(P=0.0378),CAGAT(P=0.0013),CAAGT(P=0.0373)及CAAAT(P=0.0306)。结论:根据本实验结果可初步得出结论,在中国黑龙江省妇女中,BTLA基因内含子和外显子的基因多态性与黑龙江省女性散发性乳腺癌的发病风险,临床联系及预后因素具有一定相关性。关键词:B及T淋巴细胞弱化因子论文乳腺癌论文多态性论文单体型论文
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Abstract8-10
3.
3.5.2 BTLA 基因内含子 1 SNP 位点(rs2705535)基因型检测25-26
3.5.3 BTLA 基因内含子 2 SNP 位点(rs2633562)基因型检测26-27
3.5.4 BTLA 基因内含子 2 SNP 位点(rs2931761)基因型检测27-28
3.5.5 BTLA 基因外显子 4 SNP 位点(rs9288952)基因型检测28-29
9、个人简历70-71
摘要:目的:B及T淋巴细胞弱化因子(BTLA)是免疫协同刺激分子中的一种免疫抑制性受体,其功能是通过传递抑制信号阻止淋巴细胞的活化。本实验检测B及T淋巴细胞弱化因子基因多态性与中国黑龙江省妇女散发性乳腺癌发病风险间的相关性。策略:本实验运用限制片段长度多态性聚合酶链式反应(PCR-RFLP)及两对相对引物聚合酶链式反应(PCR-CTPP)对中国黑龙江省592例无血缘联系的妇女散发性乳腺癌患者和506例相同地区的正常女性对照者BTLA基因的内含子(1rs1844089,rs2705535),内含子(2rs2633562,rs2931761)及外显子(4rs9288952)的五个多态性位点进行病例对照探讨和基因型检测。计算BTLA基因五个多态性位点的基因型频率和等位基因频率,检测结果运用统计学软件EXCEL和SPSS计算Χ2,优势比(OR)值及95%可信区间(95%CI)值。单体型检测运用Haploview软件。Chromas软件处理DNA测序结果。结果:BTLA基因五个检测位点符合Hardy-Weinberg平衡。在BTLA基因多态检测中,rs1844089CT基因型和rs2705535的AG基因型两个杂合子在患者中频率高于正常人(P=0.0164;P=0.0031),而rs1844089CC,rs2705535GG和rs9288952CC三种纯合子基因型在患者中比率却偏低(P=0.0483;P=0.0098;P=0.0400)。在各种临床联系的指标检测上,我们发现BTLA基因中5个SNP位点的基因多态性与肿瘤大小,雌激素受体(ER),孕激素受体(PR),C-erbB-2及P53都有着相关性。而在淋巴结转移中,我们未发现相关多态位点。在单体型检测中,单体型组合CAAAT在患者中比率较高(P=0.012)。与肿瘤大小,雌激素受体(ER),孕激素受体(PR)及P53相关的单体型分别为CAGAT(P=0.012),TAAGT(P=0.0378),CAGAT(P=0.0013),CAAGT(P=0.0373)及CAAAT(P=0.0306)。结论:根据本实验结果可初步得出结论,在中国黑龙江省妇女中,BTLA基因内含子和外显子的基因多态性与黑龙江省女性散发性乳腺癌的发病风险,临床联系及预后因素具有一定相关性。关键词:B及T淋巴细胞弱化因子论文乳腺癌论文多态性论文单体型论文
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Abstract8-10
1、文献综述10-17
1.1 乳腺癌探讨近况10-11
1.1 乳腺癌的发病机理10-11
1.2 乳腺癌的诊断和治疗11
1.2 基因多态性与乳腺癌的关联11-12
1.2.1 单核苷酸多态与单体型11-12
1.2.2 免疫调节基因的多态性与乳腺癌关联探讨进展12
1.3 B及T淋巴细胞弱化因子(BTLA)12-16
1.3.1 BTLA 的发现、结构特点和表达谱13-14
1.3.2 BTLA 的配体—HVEM14
1.3.3 BTLA 的生物学作用及作用机制14
1.3.4 BTLA 与疾病的联系14-16
1.4 结语16-17
2、前言17-18
3、材料与策略18-31
3.1 材料及仪器18-203.
1.1 实验试剂18-19
3.1.2 主要实验仪器19-20
3.1.3 主要运用生物医学软件及网络资源20
3.2 样本收集20-213.3 外周血白细胞基因组 DNA 的提取21-23
3.1 TIANGEN TIANamp Blood DNA Kit21-22
3.3.2 Takara Universal Genomic DNA Extraction KitVer.3.022-233.4 琼脂糖凝胶电泳检测 DNA 量23
3.5 BTLA 基因 SNP 基因型检测23-29
3.5.1 BTLA 基因内含子 1 SNP 位点(rs1844089)基因型检测23-253.5.2 BTLA 基因内含子 1 SNP 位点(rs2705535)基因型检测25-26
3.5.3 BTLA 基因内含子 2 SNP 位点(rs2633562)基因型检测26-27
3.5.4 BTLA 基因内含子 2 SNP 位点(rs2931761)基因型检测27-28
3.5.5 BTLA 基因外显子 4 SNP 位点(rs9288952)基因型检测28-29
3.6 数据浅析和处理29-31
3.6.1 计算基因型及等位基因频率29-30
3.6.2 基因型、等位基因分布差别及其与乳腺癌临床联系统计学浅析30
3.6.3 单体型分布差别及其与乳腺癌临床联系统计学浅析30
3.6.4 测序结果浅析30-31
4、结果31-49
4.1 试剂盒提取全血基因组 DNA 结果31-32
4.2 SNP在BTLA基因中位置结构示意图32-33
4.3 BTLA 基因 SNP 位点基因型检测结果33-38
4.3.1 SNP 位点 PCR 结果33-35
4.3.2 限制性内切酶酶切 PCR 产物结果35-38
4.4 BTLA 基因多态性检测统计学结果38-454.1 Hardy-Weinberg 平衡检测38
4.2 乳腺癌患者和对照人群基因型和等位基因频率比较结果38-41
4.3 单体型浅析41-42
4.4 BTLA 基因多态性与乳腺癌临床联系的相关浅析42-45
4.5 BTLA 基因 SNP 位点 PCR 产物测序结果45-49
5、讨论49-56
6、结论56-57
7、致谢57-58
8、参考文献58-709、个人简历70-71